La historia de Villaverde del Monte está relacionada con el concejo de Muñó, uno de las más importantes fortalezas y villas de Burgos, repoblada en el año 912 por el conde Munio Núñez y sus gentes. Ya el “Becerro de las Behetrías”, escrito hacia 1351, describe Minno, con sus aldeas de “Villa Vieia e Arroyo e Quinaniella e Piliella e Villa Uercede del Monte, como propios del conçeio de la çiutat de Burgos”, que pagaban impuestos al Rey. Hoy, la villa y el castillo de Muñó han desaparecido.

Desde el punto de vista económico, esta localidad está situada en una zona rica. Sus cultivos, actualmente, son de secano destacando el trigo y la cebada. Antiguamente era más bien una zona de pastos y ganadería y también existió monte de encinas y robles.